Structure et diversité génétique d'espèces fondatrices : un outil pour la gestion des zostères marines (Zostera marina) et des laminaires sucrées (Saccharina latissima) du St-Laurent

Treillefort, Marie (2023). Structure et diversité génétique d'espèces fondatrices : un outil pour la gestion des zostères marines (Zostera marina) et des laminaires sucrées (Saccharina latissima) du St-Laurent. Mémoire. Rimouski, Université du Québec à Rimouski, Département de biologie, chimie et géographie, 101 p.

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Résumé

RÉSUMÉ : Les espèces fondatrices jouent un rôle important au sein des écosystèmes marins. Une faible diversité génétique chez ces espèces peut diminuer leur résilience et la stabilité des écosystèmes. Saccharina latissima et Zostera marina sont deux espèces fondatrices de l'estuaire et du golfe du St-Laurent. Les zostères ont connu des déclins passés, ce qui pourrait avoir entraîné une perte de diversité génétique et compromettre leur potentiel adaptatif. La laminaire sucrée est cultivée dans le St-Laurent à partir d'une seule population souche, située à des centaines de kilomètres des fermes marines, ce qui pourrait avoir entraîné une contamination génétique des populations sauvages. Aucune étude de la diversité et de la structure génétique n'a encore été réalisée dans le St-Laurent pour ces deux espèces. L'objectif de mon mémoire était de caractériser la diversité génétique ainsi que la structure génétique de ces espèces à l'aide de marqueurs microsatellites et de marqueurs génomiques. Six localités ont été échantillonnées dans l'estuaire et le golfe du St-Laurent pour les zostères et 15 pour les laminaires. La diversité génétique des laminaires était faible et les populations peu structurées génétiquement. Trois groupes ont été identifiés à l'aide de SNP; (1) l'estuaire et le nord de la Gaspésie (2) la Côte-Nord et (3) le sud de la Gaspésie avec les Îles-de-la-Madeleine. La comparaison entre la génétique de la population souche des populations sauvages n'a pas révélé de contamination génétique. La faible diversité génétique serait à prendre en considération pour l'élaboration de souches d'élevage. Les populations de zostères étaient plus structurées et quatre groupes ont pu être détectés ; (1) l'estuaire (2) la Côte-Nord (3) la Gaspésie et (4) les Îles-de-la-Madeleine. L'utilisation de plants locaux pour la restauration des herbiers de zostères serait à privilégier considérant cette structuration importante des populations. -- Mot(s) clé(s) en français : Génétique des populations ; Marqueurs microsatellites ; Saccharina latissima ; Zostera marina ; DarTSeq ; Marqueurs génomiques, St-Laurent. --
ABSTRACT : Founding species play an important role in marine ecosystems. Low genetic diversity in these species can reduce their resilience and ecosystem stability. Saccharina latissima and Zostera marina are two founding species of the estuary and the Gulf of St-Lawrence. Eelgrass has experienced past declines, which may have resulted in a loss of genetic diversity and compromised their adaptive potential. Sugar kelp is cultivated in the St-Lawrence from a single stock population, located hundreds of kilometers from marine farms, which may have resulted in genetic contamination of wild populations. No study of genetic diversity and structure has been yet conducted in the St-Lawrence for these two species. The objective of my master's thesis was to characterize the genetic diversity and structure of these two species using microsatellite and genomic markers. Six locations were sampled in the estuary and Gulf of St-Lawrence for eelgrass and 15 for kelps. The genetic diversity of Laminaria was low and populations were poorly structured genetically. Three groups were identified from SNP; (1) the estuary and northern Gaspésie, (2) the North Shore and (3) southern Gaspésie with the Magdalen Islands. A comparison of the genetics of the source of wild populations did not reveal genetic contamination. Low genetic diversity should be considered in the development of culture strains. Eelgrass populations were more structured and four groups were detected; (1) the estuary, (2) the North Shore, (3) the Gaspé Peninsula and (4) the Magdalen Islands. The use of local plants for the restoration of eelgrass beds should be preferred considering this important structuring of populations. -- Mot(s) clé(s) en anglais : Population genetics; Microsatellite markers; Saccharina latissima; Zostera marina; DarTSeq; Genomic markers, St-Lawrence.

Type de document :	Thèse ou mémoire de l'UQAR (Mémoire)
Directeur(trice) de mémoire/thèse :	Dufresne, France
Information complémentaire :	Mémoire présenté dans le cadre du programme de maîtrise en gestion de la faune et de ses habitats (profil recherche) en vue de l'obtention du grade de maître ès sciences (M. Sc.).
Mots-clés :	Zostère marine; Zostera marina; Laminaire sucrée; Saccharina latissima; Saint-Laurent, Golfe du; Saint-Laurent, Estuaire du (Québec); Variabilité génétique; Génétique des populations; Structure génétique; Espèces fondatrices.
Départements et unités départementales :	Département de biologie, chimie et géographie > Biologie
Déposé par :	DIUQAR UQAR
Date de dépôt :	24 mai 2023 18:04
Dernière modification :	24 mai 2023 18:04
URI :	https://semaphore.uqar.ca/id/eprint/2330

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